Naslov projekta: Genomski pristop za rejo na izboljšano kakovost mesa pri lokalni pasmi krškopoljskega prašiča
Šifra/SICRIS: Z4-60178
Obdobje: 1. 1. 2025 - 31. 12. 2026
Nosilec: dr. Klavdija Poklukar Žnidaršič, Kmetijski inštitut Slovenije
Programska skupina: Trajnostno kmetijstvo
Financer: ARIS
Vsebina in cilj projekta
Krškopoljski prašič je edina slovenska avtohtona pasma prašiča. Pasma postaja vse bolj pomembna pri rejcih, znanstvenikih in v družbi nasploh zaradi večje ozaveščenosti o ohranjanju fenotipske in genotipske biotske raznovrstnosti, boljše prilagojenosti pasme na različne krmne vire in okoljske razmere ter prednosti za predelavo v visoko-kakovostne tradicionalne mesnine. Vseeno pa krškopoljski prašič (tako kot tudi druge lokalne pasme prašičev) še vedno ostaja premalo raziskan. Poleg ohranjanja
raznolikosti pasme, pa rejce zanima tudi izboljšanje lastnosti kakovosti mesa. To spodbuja potrebo po novih znanjih in raziskavah, kar pa je možno s fenotipskimi, genotipskimi ter transkriptomskimi orodji. Genetski parametri lastnosti kakovosti mesa in maščobe pri krškopoljskem prašiču še niso bili ocenjeni, vendar so bistveni za razvoj rejskega programa. Izziv pri krškopoljskem prašiču predstavlja tudi visoka frekvenca neželenega alela na RYR1 genu, ki ima negativen vpliv na nekatere
lastnosti kakovosti mesa. Pri lokalni pasmi je potrebno posebno skrb posvetiti ohranjanju genetske raznolikosti ter preprečevanju parjenja v sorodstvu. Tudi vpliv načina reje vpliva na genetske mehanizme odgovorne za različno kakovosti mesa in maščobe, kar prav tako še ni bilo raziskano pri pasmi krškopoljski prašič.
Da bi odgovorili na omenjene vrzeli v znanju, so v projektu zastavljeni naslednji cilji:
-
ocenjevanje možnosti za vključitev lastnosti kakovosti mesa v rejski program,
-
raziskati razlike v izražanju genov v različnih sistemih reje in z različno prehrano s transkriptomskim (RNA-sekvenciranjem) pristopom ter
-
diseminacija in uporaba dobljenih rezultatov.
V prvem delu bomo s pomočjo fenotipskih in genotipskih podatkov ocenili genetske parametre (genetske korelacije med lastnostmi, heritabiliteta) različnih lastnosti in na ta način preverili potencial pasme za rejo na izboljšano kakovost mesa. Naredili bomo asociacijsko analizo na ravni celotnega genoma z namenom odkrivanja novih polimorfizmov povezanih z lastnostmi kakovosti mesa. Prav tako bomo izvedli pilotno študijo, ki bo preučevala kako razviti rejski program s pomočjo prilagojene metode
selekcije optimalnega prispevka. V drugem delu se bomo osredotočili na identifikacijo diferencialno izraženih genov s pomočjo RNA-sekvenciranja glede na način reje in z različno prehrano (krma z nizko vsebnostjo proteinov vs. krma s standardno vsebnostjo proteinov). Rezultati projekta bodo v pomoč pri razvoju rejskega programa krškopoljskega prašiča v povezavi s kakovostjo mesa in bodo pomagali pri oceni potencialnih prednosti/slabosti različne prehrane in reje na lastnosti kakovosti mesa pri
krškopoljskem prašiču.
Rezultati projekta
Poklukar Žnidaršič, Klavdija, Čandek-Potokar, Marjeta, Mercat, Marie-José, Savić, Bojana, Škrlep, Martin. Analiza povezave med genom MC4R ter mesnimi in klavnimi lastnostmi pri krškopoljskem prašiču = Association analysis between the MC4R polymorphism and carcass and meat quality traits in the Krškopolje pig. V: ČEH, Tatjana (ur.), KAPUN, Stanko (ur.). 33. mednarodno znanstveno posvetovanje o prehrani domačih živali
[tudi] Zadravčevi-Erjavčevi dnevi 2025 = 33nd International Scientific Symposium on Nutrition of Farm Animals [being] Zadravec-Erjavec Days 2025 : zbornik predavanj = proceedings : Radenci, 13. in 14. november 2025, 13th and 14th November 2025. Murska Sobota: Kmetijsko gozdarska zbornica Slovenije, Kmetijsko gozdarski zavod, 2025. Str. 175-179.
Škrlep, Martin, Poklukar Žnidaršič, Klavdija, Savić, Bojana, Čandek-Potokar, Marjeta. Studying husbandry and nutrition in krškopolje pig : implications for fat deposition and meat quality with insights into metabolism and gene expression. V: ŠKRBIĆ, Zdenka (ur.). 15th International Symposium Modern trends in livestock production : 29-31 October 2023, Belgrade, Serbia : proceedings. Belgrade: Institute for Animal
Husbandry, 2025. Str. 174-186.
Poklukar, K., Čandek-Potokar, M., Mercat, M. J.,Banville, M., Taussat, S., Škrlep, M. (2025). Assessing the genetic contribution to intramuscular fat content in local Krškopolje pig. V: Book of abstracts of the 76th Annual Meeting of The European
Federation of Animal Science, Innsbruck, Austria, 25 - 29 August, EAAP.
Škrlep, M., Poklukar, K., Savić, B., Čandek-Potokar, M. (2025). Voluntary feed intake of local Krškopolje pig breed from 30 to 100 kg: variability, sex differences and comparison to modern hybrids. V: Book of abstracts of the 76th Annual Meeting of The European
Federation of Animal Science, Innsbruck, Austria, 25 - 29 August, EAAP.
Poklukar, K., Čandek-Potokar, M., Savić, B., Škrlep, M. (2025). Influence of rearing systems on the liver transcriptome profile of krškopolje pigs: indoor vs. outdoor conditions. V: Book of abstracts of the 76th Annual Meeting of The European
Federation of Animal Science, Innsbruck, Austria, 25 - 29 August, EAAP.
Zorc, M., Poklukar, K., Škrlep, M., Čandek-Potokar, M., Dovč, P. (2025). Genetic insights into backfat thickness and fatty acid composition in Krškopolje pig: Differential gene expression linked to genetic variants. V: Book of abstracts of the 76th Annual Meeting of The European Federation of Animal Science, Innsbruck, Austria, 25 - 29 August, EAAP.
POKLUKAR, Klavdija, ČANDEK-POTOKAR, Marjeta, VRECL, Milka, BRANKOVIČ, Jana, URŠIČ, Matjaž, ŠKRLEP, Martin. The effect of reduced dietary protein on adipose tissue in local krškopolje pigs. International journal of molecular sciences. 2025, vol. 26, iss. 9, str. 1-16, ilustr. ISSN 1422-0067.
POKLUKAR, Klavdija, ČANDEK-POTOKAR, Marjeta, MERCAT, Marie-José, BANVILLE, Maxime, ŠKRLEP, Martin. Estimating the heritability of meat quality traits in Krškopolje pigs. V: Book of abstracts of the 3rd Regional Meeting of the European Federation of Animal Science : Krakow, Poland 9-11 April, 2025. Krakow: EAAP, 2025. Str. 44. Book of Abstracts, No. 36.
POKLUKAR, Klavdija, ČANDEK-POTOKAR, Marjeta, VRECL, Milka, ŠKRLEP, Martin. Feed stress-induced transcriptomic changes in the liver of Krškopolje pigs reared in the outdoor system. V: Book of abstracts of the 3rd Regional Meeting of the European Federation of Animal Science : Krakow, Poland 9-11 April, 2025. Krakow: EAAP, 2025. Str. 78. Book of Abstracts, No. 36.
POKLUKAR , Klavdija, ČANDEK-POTOKAR, Marjeta, ŠKRLEP, Martin. Reduced protein diet effect on adipose tissue deposition in Krškopolje pig reared in the outdoor and indoor conditions : expression profiling by high throughput sequencing : Sus scrofa : Series GSE292746. Ljubljana: Kmetijski inštitut Slovenije, 2025.
POKLUKAR, Klavdija, ČANDEK-POTOKAR, Marjeta, MERCAT, Marie-José, BANVILLE, Maxime, ŠKRLEP, Martin. Možnost selekcije na kakovost mesa pri kroškopoljskem prašiču : predavanje za Usposabljanja s preizkusom znanja za izvajalce najzahtevnejših strokovnih nalog v živinoreji, 11. in 12. feb. 2025, Kmetijski inštitut Slovenije.