Sodelavec Kmetijskega inštituta Slovenije Nik Susič je 26. oktobra 2020 na Biotehniški fakulteti Univerze v Ljubljani doktoriral z naslovom: UPORABA NAPREDNIH TEHNOLOGIJ ZA CELOSTEN PRISTOP OBVLADOVANJA OGORČIC KORENINSKIH ŠIŠK (Meloidogyne spp., NEMATODA: Meloidogynidae). Disertacijo je pripravil pod mentorstvom dr. Barbare Gerič Stare.
V doktorski disertaciji je predstavljena problematika tropskih vrste ogorčic koreninskih šišk (RKN), ki so škodljivci v kmetijstvu in povzročajo velike izgube pridelka. Vrste ki so bile obravnavane so tudi zelo podobne med seboj in jih je, zaradi visoke sorodnosti, težavno razlikovati. Sekveniranih je bilo 7 izolatov ogorčic iz skupine MEG in zloženi so bili celotni genomi teh izolatov. Zloženi genom ogorčice vrste Meloidogyne luci, ki je bila izolirana v Sloveniji, je trenutno najpopolnejši javno dostopen genom RKN. Preizkušena je bila uporabnost hiperspektralnega slikanja za zgodnje razločevanje biotskega stresa (napad RKN) od abiotskega stresa (suša) pri rastlinah paradižnika. Z analizo hiperspektralnih posnetkov je bilo mogoče razlikovati med zalitimi in sušnimi rastlinami ter med z ogorčicami napadenimi rastlinami in zdravimi. V nadaljevanju je bila ovrednotena nematicidna aktivnost in analizirana genoma bakterije Bacillus firmus. V genomu so bili ugotovljeni številni potencialni dejavniki virulence. V in vitro poskusih in v lončnih poskusih ter poskusih na mikroparcelah je bil ovrednoten vpliv bakterij na zatiranje ogorčice in na spodbujanje rasti testnih rastlin, kar je bilo dokazano z meritvami morfologije rastlin, relativne vsebnosti klorofila, vsebnostjo elementov in analizo hiperspektralnih posnetkov.
V raziskavah so bile uporabljene sodobne in inovativne raziskovalne metode, med drugim metode določanja nukleotidnih zaporedij celotnih genomov, bioinformatike, hiperspektralne analize rastlinskega tkiva, strojnega učenja, metode za analizo fiziološkega stanja rastlin in statistike.
Sodelavcu iskreno čestitamo.