Genetski laboratorij

Genetski laboratorij Kmetijskega inštituta Slovenije je bil ustanovljen leta 1998 na takratnem Oddelku za poljedelstvo in semenarstvo. Danes je genetski laboratorij del Skupine za genetiko in žlahtnjenje na Oddelku za rastlinsko pridelavo (ORP) in je edini molekularni laboratorij na Kmetijskem inštitut Slovenije. V sklopu genetskega laboratorija delujeta še Laboratorij za tkivne kulture ter Laboratorij za ekofiziologijo in vrednotenje pridelkov.

Laboratorij je opremljen z napravami in aparaturami, ki omogočajo raziskave na področju molekularne biologije, (populacijske) genetike, genomike, DNA markerjev, NGS-based aplikacij, transkriptomike in metabolomike rastlin, rastlinskih patogenov ter živali. Akreditiran je po standardu ISO 9001 ter za nekatere metode tudi po standardu ISO17025. 

Večja analizna raziskovalna oprema

• razkrojevalec tkiv (TissueLyser, Qiagen),
• avtomatiziran sistem za pripravo reakcijskih mešanic QIAgility (Qiagen),
• pretočni citometer CyFlow (Partec/Sysmex),
• avtomatiziran sistem za ekstrakcijo nukleinskih kislin (KingFisher in MagMax, Thermo Fisher Scientific),
• QIAxcel Advanced kapilarna elektroforeza (Qiagen),
• analizator nukleinskih kislin in proteinov (Agilent),
• različni tipi cikličnih termostatov (ABI Veriti, ABI Veriti PRO, SureCycler Agilent, ABI9700),
• fluorometer (Qubit 3.0),
• stresalnik z gretjem (za macroarray, GeneTop Biotech),
• horizontalna elektroforeza s sistemom za fotografiranje gelov (Biometra, GeneGenius),
• sistem za vertikalno elektroforezo (Biometra),
• NanoDrop One Microvolume UV-Vis Spektrofotometer (Thermo) (VRO paket 22), 
• digitalni PCR QuantStudio Absolute Q (Applied Biosystems) (VRO paket 22),
• PCR v realnem času QuantStudio 5 Real-Time PCR System (Applied Biosystems) (VRO paket 22) in PCR v realnem času ABI7500 z nadgradnjo v fast in HRM (Applied Biosystems),
• dodatna oprema, ki je na voljo na CFGBC/MF in BF za souporabo s Kmetijskim inštitutom Slovenije kot članom konzorcija.

Raziskave, ki so povezane z delom v genetskem laboratoriju se na Kmetijskem inštitutu izvajajo v sklopu treh programskih skupin Agrobiodiverziteta, Trajnostno kmetijstvo in Kmetijstvo naslednje generacije. Laboratorij (so)uporabljajo sodelavci ORP, Oddelka za varstvo rastlin (OVR) in Oddelka za živinorejo (OŽ). 

Kontakt