Škodljivim (parazitskim) nematodam v kmetijstvu pravimo ogorčice. Letno ogorčice v kmetijstvu na svetovni ravni povzročijo škodo v višini 110 milijard € letno. Zaradi globalnega segrevanja in podnebnih sprememb se pri nas že pojavljajo škode zaradi eksotičnih – tropskih vrst ogorčic, ki jih v preteklosti nismo poznali. Za zatiranje ogorčic v kmetijski pridelavi imamo žal na voljo precej omejene možnosti. Določene vrste ogorčic imajo zelo širok nabor gostiteljskih rastlin, zato je pri takih vrstah kolobarjenje posevkov neučinkovito. Najbolj učinkoviti ukrepi so preventivni, s čimer preprečujemo vnos in širjenje nevarnih vrst na kmetijska zemljišča.
Področja dela
Raziskovalno delo
- Zgodnje zaznavanje napada ogorčic
- Zatiranje in obvladovanje ogorčic (vključno z biotičnimi pristopi)
- Preučevanje biologije ogorčic (npr. virulenca, preživetje)
- Genomske študije ogorčic
- Ogorčice kot vektorji za prenos rastlinskih virusov
- Razvoj diagnostike ogorčic
- Modeliranje potencialne razširjenosti ogorčic (vključno s scenariji podnebnih sprememb)
- Modeliranje razvojnega cikla ogorčic
Strokovno delo
- Diagnostika ogorčic: detekcija in identifikacija (morfološka, molekularno-biološka in biokemijska identifikacija vrst)
- Svetovanje glede ukrepov za obvladovanje ogorčic
- Sistematični nadzor nad karantenskimi vrstami: krompirjeve ogorčice vrst Globodera rostochiensis in G. pallida, borove ogorčice Bursaphelenchus xylophilus in ogorčicami koreninskih šišk vrst Meloidogyne chitwoodi, M. fallax
- Nadzor nad drugimi karantenskimi in gospodarsko škodljivimi vrstami (M. enterolobii, M. graminicola, Ditylenchus dipsaci, D. destructor, Xiphinema americanum, X. index, Aphelenchoides besseyi itd.)
Člani nematološke skupine
dr. Barbara Gerič Stare, dr. Saša Širca, Julija Polanšek, dr. Melita Theuerschuh, dr. Nik Susič,
Izbrane publikacije
POLANŠEK, Julija, TRDAN, Stanislav, ŠIRCA, Saša. Ogorčica Xiphinema index Thorne & Allen, 1950, prenašalec virusa pahljačavosti listov vinske trte. Acta agriculturae Slovenica. [Spletna izd.]. 2024, vol. 120, no. 3, 10 str. ISSN 1854-1941. https://journals.uni-lj.si/aas/article/view/19008/16395, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije – dLib.si, DOI: 10.14720/aas.2024.120.3.19008.
ŽIBRAT, Uroš, GERIČ STARE, Barbara, KNAPIČ, Matej, SUSIČ, Nik, LAPAJNE, Janez, ŠIRCA, Saša. Detection of root-knot nematode Meloidogyne luci infestation of potato tubers using hyperspectral remote sensing and real-time PCR molecular methods. Remote sensing. 2021, vol. 13, iss. 10, str. 1-21, ilustr. ISSN 2072-4292. https://www.mdpi.com/2072-4292/13/10/1996.
SUSIČ, Nik, JANEŽIČ, Sandra, RUPNIK, Maja, GERIČ STARE, Barbara. Whole genome sequencing and comparative genomics of two nematicidal bacillus strains reveals a wide range of possible virulence factors. G3. Mar. 2020, vol. 10, iss. 3, str. 881-890, ilustr. ISSN 2160-1836. DOI: 10.1534/g3.119.400716.
SUSIČ, Nik, KOUTSOVOULOS, Georgios D., RICCIO, Cristian, DANCHIN, Étienne G. J., BLAXTER, Mark L., LUNT, David H., STRAJNAR, Polona, ŠIRCA, Saša, UREK, Gregor, GERIČ STARE, Barbara. Genome sequence of the root-knot nematode Meloidogyne luci. Journal of nematology. 2020, vol. 52, e2020-25, str. 1-5. ISSN 0022-300X. https://www.exeley.com/journal_of_nematology/doi/10.21307/jofnem-2020-025, DOI: 10.21307/jofnem-2020-025.
SUSIČ, Nik, ŽIBRAT, Uroš, SINKOVIČ, Lovro, VONČINA, Andrej, RAZINGER, Jaka, KNAPIČ, Matej, SEDLAR, Aleš, ŠIRCA, Saša, GERIČ STARE, Barbara. From genome to field-observation of the multimodal nematicidal and plant growth-promoting effects of Bacillus firmus I-1582 on tomatoes using hyperspectral remote sensing. Plants. 2020, vol. 9, no. 5, str. 1-27. ISSN 2223-7747. DOI: 10.3390/plants9050592.
GERIČ STARE, Barbara, AYDINLI, Gökhan, DEVRAN, Zübeyir, MENNAN, Sevilhan, STRAJNAR, Polona, UREK, Gregor, ŠIRCA, Saša. Recognition of species belonging to Meloidogyne ethiopica group and development of a diagnostic method for its detection. European journal of plant pathology. 2019, vol. 154, iss. 3, str. 621-633. ISSN 0929-1873. DiRROS – Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije, DOI: 10.1007/s10658-019-01686-2.
GERIČ STARE, Barbara, STRAJNAR, Polona, ŠIRCA, Saša, SUSIČ, Nik, UREK, Gregor. Record of a new location for tropical root knot nematode Meloidogyne luci in Slovenia. Bulletin OEPP. April 2018, vol. 48, no. 1, str. 135-137. ISSN 0250-8052. http://onlinelibrary.wiley.com/journal/10.1111/(ISSN)1365-2338, DiRROS – Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije, DOI: 10.1111/epp.12443.
GERIČ STARE, Barbara, STRAJNAR, Polona, SUSIČ, Nik, UREK, Gregor, ŠIRCA, Saša. Reported populations of Meloidogyne ethiopica in Europe identified as Meloidogyne luci. Plant disease. Sep. 2017, vol. 101, no. 9, str. 1627-1632. ISSN 0191-2917. DOI: 10.1094/PDIS-02-17-0220-RE.
BAČIĆ, Jasmina, PAVLOVIČ, Martin, KUŠIĆ-TIŠMA, Jelena, ŠIRCA, Saša, THEUERSCHUH, Melita, GERIČ STARE, Barbara. First report of the root-knot nematode Meloidogyne luci on tomato in Serbia. Plant disease. 2023, vol. 107, iss. 8, str. 2554, ilustr. ISSN 1943-7692. DOI: 10.1094/PDIS-01-23-0164-PDN.
