Kmetijski inštitut Slovenije vodi, zastopa in predstavlja direktor, ki je poslovodni organ s petletnim mandatom. Upravni odbor je organ upravljanja, ki imenuje in razrešuje direktorja, komisije in druga delovna telesa, sprejema splošne akte, strategijo razvoja, programe dela in poročila inštituta, odloča o zadevah gospodarske in materialne narave itd. Znanstveni svet je strokovni organ, ki obravnava in podaja mnenja o pravilnikih, programih, poročilih in drugih aktih, izvaja izvolitve v nazive ter usmerja razvoj raziskovalnega in strokovnega dela na področjih delovanja Kmetijskega inštituta Slovenije.
Direktor: prof. dr. Andrej Simončič
Upravni odbor
Upravni odbor KIS je v mandatnem obdobju 2022–2026 konstituiran v sestavi:
- prof. dr. Franc Štampar, predsednik, predstavnik iz vrst uporabnikov KIS oziroma zainteresirane javnosti,
- Mateja Tilia, namestnica predsednika, predstavnica na predlog ministrstva pristojnega za visoko šolstvo, znanost in inovacije,
- Lidija Lipič Berlec, predstavnica na predlog ministrstva pristojnega za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano,
- Irena Anica Oven, predstavnica na predlog ministrstva pristojnega za naravne vire in prostor,
- Nina Barbara Križnik*, predstavnica iz vrst uporabnikov KIS oziroma zainteresirane javnosti,
- Anton Jagodic, predstavnik iz vrst uporabnikov KIS oziroma zainteresirane javnosti,
- dr. Irena Mavrič Pleško, izvoljena iz vrst zaposlenih na KIS.
*od 8. 9. 2023 (do 7. 9. 2023 dr. Tatjana Zagorc)
Znanstveni svet
Znanstveni svet KIS je v mandatnem obdobju 2022–2026 konstituiran v sestavi:
- prof. dr. Andrej Simončič, direktor KIS
- prof. dr. Marjeta Čandek-Potokar, predsednica***
- dr. Kristina Ugrinović, namestnica predsednice***
- dr. Barbara Gerič Stare**
- dr. Matej Stopar
- dr. Špela Velikonja Bolta
- dr. Maja Kožar
- dr. Vladimir Meglič*
- dr. Jaka Razinger*
*od 18. 5. 2023 po sklepu direktorja, skladno z novim Statutom Kmetijskega inštituta Slovenije
**do 22. 1. 2024: predsednica
***od 22. 1. 2024