Ime projekta Vzpostavitev sistema uporabe DNA markerjev za genetsko identifikacijo pri preverjanju sortne pristnosti in čistosti pomembnejših vrst žit in križnic kot osnova za kakovostno pridelavo semenskih posevkov ter varno in kakovostno pridelano hrano in krmo

Šifra / SICRIS

V4-1806

Trajanje projekta

1. 11. 2018 – 31. 10. 2021

Odgovorni nosilec

 dr. Vladimir Meglič (KIS)

Projektna skupina Seznam raziskovalcev in tehničnega osebja

Sodelujoče organizacije

Kmetijski inštitut Slovenije

Financerja

Bibliografija projekta

SICRIS

  Kratek opis raziskovalnega projekta

 

Sortna pristnost in kakovostno seme sort, ki so prilagojene slovenskim pridelovalnim razmeram, sta ključnega pomena za uspešno kmetijsko pridelavo in posledično za zagotavljanje prehranske varnosti in zmanjšanje tveganja v kmetijski pridelavi. Nova pravila mednarodne zveze za testiranje semena ISTA (International Seed Testing Association) z dne 1.1.2017 uvajajo bolj zanesljive postopke določitve sortne pristnosti, ki temeljijo na uporabi DNA markerjev. Glede na aktualnost tematike ISTA pripravlja tudi priročnik o preverjanju sortne pristnosti z uporabo metod na osnovi DNA (angl. t.i. DNA-based variety identification), ki bo izšel v letu 2019. ISTA delovna skupina za sortnost v svojem poročilu 2016-2017 poroča o uvajanju SSR (Simple Sequence Repeat) markerjev za pšenico. V splošnem je pri različnih vrstah najbolj široko uporabljeno molekulsko orodje prav aplikacija SSR markerjev, za določene rastlinske vrste pa je v fazi uvajanja tudi genotipizacija z uporabo še preciznejših SNP (Single Nucleotide Polymorphism) markerjev (ISTA News Bulletin, 154, October 2017). V okviru delovne skupine OECD (Organisation for Economic Co-operation and Development) Seed Schemes je bila Služba za uradno potrjevanje semenskega in sadilnega materiala kmetijskih rastlin (SUP) na Kmetijskem inštitutu Slovenije kot slovenski certifikacijski organ pozvana, da se opredeli glede izvajanja biokemičnih in molekulskih analiz za preverjanje sortne čistosti, identifikacije ter hibridizacije znotraj posameznih rastlinskih vrst, za katere bi lahko izvajali analize. Tudi s te strani je močan poudarek na aplikaciji DNA markerjev na račun opuščanja analiz na osnovi biokemičnih markerjev. V zadnjem obdobju si žlahtnitelji vse bolj prizadevajo, da bi imela vsaka sorta ob svojem opisu predpisano tudi metodiko genetske identifikacije ter dostopen genetski profil določenih lokusov v genomu, na podlagi katerih se sorte med seboj zanesljivo in učinkovito loči. Posledično se v smislu zaščite žlahtniteljskih pravic (angl. breeders rights) žlahtnitelji vedno bolj poslužujejo uporabe novih zanesljivih metod, ki sorte med seboj učinkovito ločijo in to je z uporabo DNA markerjev. Dejansko se tudi pri potrjevanju semenskih posevkov tekom vegetacije pojavlja problem identifikacije sort netipičnih rastlin predvsem znotraj vrst žit in križnic. Uporabnost genetske identifikacije sort se kaže pri analizah kakovosti semena v laboratoriju, ko se na osnovi morfoloških znakov semena pri analizi čistote in klic v postopku kalivosti pojavlja sum na drugo sorto, vrsto ali celo rod. Nove sorte so si namreč vedno bolj morfološko podobne zato je njihova identifikacija na osnovi vidnih znakov vedno težja. Znotraj predlaganega projekta želimo vzpostaviti zanesljivo in učinkovito genetsko orodje, s pomočjo katerega bomo v primeru dvoma na nivoju fenotipsko izraženih lastnosti pri preverjanju sortne čistosti in pristnosti tako posevkov kot tudi vzorcev semena, ciljno identificirali rod/vrsto/sorto pomembnejših predstavnikov znotraj žit in križnic. Vzpostavljen sistem z uporabo molekulskih markerjev bi nam tako omogočil genomsko-specifično in sortno ločevanje predvsem znotraj/med vrstami žit in križnic, ki se v pridelujejo Sloveniji. Preko vzpostavljenih metod in z njihovo uporabo bomo lahko nudili podporo tudi pri nadzoru PRP, predvsem pri podukrepu GEN_SOR. Cilji predlaganega projekta so:

-  Razvoj in vzpostavitev sistema za genetsko identifikacijo rodu/vrste/sorte z uporabo DNA markerjev pri agronomsko pomembnih vrstah žit in križnic, ki so vpisane na slovenski ali evropski sortni listi ter se njihov material prideluje ali uradno potrjuje v Sloveniji (npr. Triticum aestivum L. Emend. Fiori et Paol. (navadna pšenica); Brassica napus L.(partim.) (navadna ogrščica); Fagopyrum esculentum (Moench) (navadna ajda); Hordeum vulgare L. (navadni ječmen); itd). Poleg tega bo nabor vključeval tudi vrste, ki jih je na nivoju fenotipa in morfoloških karakteristik semena, klic ali rastlin v semenski pridelavi težko identificirati in razločevati.

-  Prilagoditev obstoječih postopkov uradnega potrjevanja oziroma metod preverjanja sortne pristnosti in čistosti ter ugotavljanja dovoljenega deleža netipičnih rastlin (samoprašnih v primeru hibridnih sort) in rastlin druge sorte v semenskih posevkih in v partijah semena tako, da bo poleg konvencionalnih metod, z uporabo sistema DNA markerjev kot dodatnim orodjem v primeru dvoma, identifikacijo možno izvesti že v prvi fazi postopka uradnega potrjevanja, kar bo prispevalo k boljši kakovosti semena na trgu.

-   Priprava metodoloških dokumentov in informacij za vzpostavitev baz podatkov o alelnih profilih sort, ki so vpisane v sortno listo in se njihov material prideluje oz. uradno potrjuje v Sloveniji.

 


Naša spletna stran uporablja piškotke, ki se naložijo na vaš računalnik. Ali se za boljše delovanje strani strinjate z njihovo uporabo?

Več o uporabi piškotkov

Uporaba piškotkov na naši spletni strani

Pravna podlaga

Podlaga za obvestilo je spremenjeni Zakon o elektronskih komunikacijah (Uradni list št. 109/2012; v nadaljevanju ZEKom-1), ki je začel veljati v začetku leta 2013. Prinesel je nova pravila glede uporabe piškotkov in podobnih tehnologij za shranjevanje informacij ali dostop do informacij, shranjenih na računalniku ali mobilni napravi uporabnika.

Kaj so piškotki?

Piškotki so majhne datoteke, pomembne za delovanje spletnih strani, največkrat z namenom, da je uporabnikova izkušnja boljša.

Piškotek običajno vsebuje zaporedje črk in številk, ki se naloži na uporabnikov računalnik, ko ta obišče določeno spletno stran. Ob vsakem ponovnem obisku bo spletna stran pridobila podatek o naloženem piškotku in uporabnika prepoznala.

Poleg funkcije izboljšanja uporabniške izkušnje je njihov namen različen. Piškotki se lahko uporabljajo tudi za analizo vedenja ali prepoznavanje uporabnikov. Zato ločimo različne vrste piškotkov.

Vrste piškotkov, ki jih uporabljamo na tej spletni strani

Piškotki, ki jih uporabljamo na tej strani sledijo smernicam:

1. Nujno potrebni piškotki

Tovrstni piškotki omogočajo uporabo nujno potrebnih komponent za pravilno delovanje spletne strani. Brez teh piškotov servisi, ki jih želite uporabljati na tej spletni strani, ne bi delovali pravilno (npr. prijava, nakupni proces, ...).

2. Izkustveni piškotki

Tovrstni piškotki zbirajo podatke, kako se uporabniki vedejo na spletni strani z namenom izboljšanja izkustvene komponente spletne strani (npr. katere dele spletne strani obiskujejo najpogosteje). Ti piškotki ne zbirajo informacij, preko katerih bi lahko identificirali uporabnika.

3. Funkcionalni piškotki

Tovrstni piškotki omogočajo spletni strani, da si zapomni nekatere vaše nastavitve in izbire (npr. uporabniško ime, jezik, regijo) in zagotavlja napredne, personalizirane funkcije. Tovrstni piškotki lahko omogočajo sledenje vašim akcijam na spletni strani.

4. Oglasni ali ciljani piškotki

Tovrstne piškotke najpogosteje uporabljajo oglaševalska in družabna omrežja (tretje strani) z namenom, da vam prikažejo bolj ciljane oglase, omejujejo ponavljanje oglasov ali merijo učinkovitost oglaševalskih akcij. Tovrstni piškotki lahko omogočajo sledenje vašim akcijam na spletu.

Nadzor piškotkov

Za uporabo piškotkov se odločate sami. Piškotke lahko vedno odstranite in s tem odstranite vašo prepoznavnost na spletu. Prav tako večino brskalnikov lahko nastavite tako, da piškotkov ne shranjujejo.

Za informacije o možnostih posameznih brskalnikov predlagamo, da si ogledate nastavitve.

Upravljalec piškotkov

Kmetijski inštitut Slovenije