Mikologija

Kultura glive Acaromyces ingoldii izolirane s plodov kakija (Diospyros kaki), ki izloča rdeč pigment v gojišče

Kultura glive Acaromyces ingoldii izolirane s plodov kakija (Diospyros kaki), ki izloča rdeč pigment v gojišče

Sporangij (zgoraj) in klamidospore (spodaj) oomicetne plesni Phytophthora ramorum, ki povzroča fitoftorno sušico vejic

Sporangij (zgoraj) in klamidospore (spodaj) oomicetne plesni Phytophthora ramorum, ki povzroča fitoftorno sušico vejic

Kutina (Cydonia oblonga) z izraženimi simptomi okužbe z Gymnosporangium sp.

Kutina (Cydonia oblonga) z izraženimi simptomi okužbe z Gymnosporangium sp.

Jabolko s simptomi okužbe z glivo Neofabraea vagabunda.

Jabolko s simptomi okužbe z glivo Neofabraea vagabunda.

Značilni tros glive Alternaria cucumerina.

Značilni tros glive Alternaria cucumerina.

Padavica sadik, ki jo povzroča oomiceta Globisporangium (Pythium) mastophorum, ki smo jo potrdili v Sloveniji med prvimi v Evropi. Test patogenosti na sadikah peteršilja (Petroselinum crispum), levo – okužene rastline, desno – zdrave rastline.

Padavica sadik, ki jo povzroča oomiceta Globisporangium (Pythium) mastophorum, ki smo jo potrdili v Sloveniji med prvimi v Evropi. Test patogenosti na sadikah peteršilja (Petroselinum crispum), levo – okužene rastline, desno – zdrave rastline.

Značilne oospore s stožčastimi izrastki oomicete Globisporangium (Pythium) mastophorum z obolelih rastlin peteršilja.

Značilne oospore s stožčastimi izrastki oomicete Globisporangium (Pythium) mastophorum z obolelih rastlin peteršilja.

Simptomi bolezni kakijeve listne pegavosti, ki jo povzroča gliva Plurivorosphaerella nawae.

Simptomi bolezni kakijeve listne pegavosti, ki jo povzroča gliva Plurivorosphaerella nawae.

Spolno trosišče pepelaste plesni Erysiphe corylacearum z listnega tkiva leske, ki smo jo prvič potrdili v Sloveniji v letu 2020.

Spolno trosišče pepelaste plesni Erysiphe corylacearum z listnega tkiva leske, ki smo jo prvič potrdili v Sloveniji v letu 2020.

Kultura glive Diaporthe amygdali iz delovne zbirke izolatov gliv KIS.

Kultura glive Diaporthe amygdali iz delovne zbirke izolatov gliv KIS.

Ugotavljanje odpornosti glive Zymoseptoria tritici, povzročiteljice pšenične listne pegavosti, v jamicah mikrotitrne plošče pri različnih koncentracijah epoksikonazola (levo zgoraj) in protikonazola (desno zgoraj). Ugotavljanje mutacij tarčnih genov aktivnih snovi z določanjem zaporedij DNK (spodaj).

Ugotavljanje odpornosti glive Zymoseptoria tritici, povzročiteljice pšenične listne pegavosti, v jamicah mikrotitrne plošče pri različnih koncentracijah epoksikonazola (levo zgoraj) in protikonazola (desno zgoraj). Ugotavljanje mutacij tarčnih genov aktivnih snovi z določanjem zaporedij DNK (spodaj).

Vzorčenje vode za testiranje na prisotnost oomicet rodu Phytophthora v sklopu projekta Euphresco.

Vzorčenje vode za testiranje na prisotnost oomicet rodu Phytophthora v sklopu projekta Euphresco.

Značilni bolezenski znaki ESKE na listih vinske trte.

Značilni bolezenski znaki ESKE na listih vinske trte.

Dvojna kultura gliv (3 kolonije ob robu gojišča), ki zavirajo rast sive plesni Botrytis cinerea (na sredini gojišča).

Dvojna kultura gliv (3 kolonije ob robu gojišča), ki zavirajo rast sive plesni Botrytis cinerea (na sredini gojišča).

Mikološki laboratorij

Mikološki laboratorij OVR sestavlja ekipa strokovnjakov, ki se strokovno in raziskovalno ukvarjajo z glivami in oomicetami na področju integriranega in ekološkega varstva rastlin.

S strani Uprave za varno hrano, veterinarstvo in varstvo rastlin smo imenovani za Uradni laboratorij za glive in oomicete.

Poleg tega smo partnerji konzorcija Nacionalnega referenčnega laboratorija za glive in oomicete (na poljščinah, vrtninah in sadnih rastlinah, oomicete na vseh rastlinah).

Strokovno delo mikološkega laboratorija:

- Diagnostika

  • Izvajamo detekcijo in identifikacijo fitopatogenih gliv ter oomicet (glivam podobni organizmi) z morfološkimi in različnimi molekularnimi metodami identifikacije (določanje črtnih kod, specifične reakcije PCR, kvantitativni qPCR).
  • Delo izvajamo skladno s standardom SIST EN ISO/IEC 17025:2017, ki opredeljuje zahteve za usposobljenost preskuševalnih laboratorijev (Akreditacijska listina LP-020- Kmetijski inštitut Slovenije).
  • Mikološki laboratorij ima akreditirani dve metodi za detekcijo in identifikacijo Phytophthora ramorum, ki povzroča fitoftorno sušico vejic:
  1. Izolacija in morfološka identifikacija Phytophthora ramorum po EPPO standardu PM7/66(1) Phytophthora ramorum Eppo Bulletin (2006) 36, 145-155 (MET-MIK-003)
  2. Identifikacija vrste Phytophthora ramorum s PCR (MET-MIK-004), ki temelji na standardu International Plant Protection Convention (IPPC), International standard for phytosanitary measures 27 (ISPM 27), Diagnostic protocols 23: Phytophthora ramorum. ISPM 27 Diagnostic protocols for regulated pests (2017), DP 23-1 – DP 23-24; poglavje 3.6.3.1, modificirana metoda.

 

- Odkrivanje novih vrst (gospodarsko) pomembnih gliv in oomicet v Sloveniji in širše.

- Sistematične raziskave glivičnih bolezni izbranih kmetijskih rastlin: kaki, oljka, sladki krompir, šparglji, leska in druge.

- Svetovanje o preventivnih ukrepih in metodah zatiranja in obvladovanja glivičnih bolezni kmetijskih rastlin.

- Sistematično spremljanje karantenskih vrst gliv (Phyllosticta solitaria, Tilletia indica in drugimi vrstami po programu preiskav).

- Spremljanje pojavljanja reguliranih nadzorovanih nekarantenskih fitopatogenih gliv in oomicet (NNŠO) na sadilnem materialu in semenih.

- Priprava in vzdrževanje zbirke referenčnega materiala in delovne zbirke izolatov gliv.

- Vpeljava različnih orodij in metod za upravljanje z odpornostjo in preučevanje odpornosti izbranih gliv (npr. Botrytis cinerea, Zymoseptoria tritici) proti fungicidom (ugotavljanje efektivnih koncentracij, odkrivanje mutacij v populacijah škodljivih organizmov).

 

Raziskovalno delo mikološkega laboratorija

Naše raziskovalno delo se osredotoča na:

  • taksonomijo, filogenijo in biologijo v kmetijstvu pomembnih gliv (tako patogenih kot koristnih za rast rastlin ali nadzor bolezni),
  • uporabo gliv v biotičnem varstvu rastlin,
  • razvojem metod za identifikacijo in detekcijo izbranih vrst gliv ter  
  • zgodnjim odkrivanjem glivičnih bolezni v sodelovanju z drugimi področji dela oddelka za varstvo rastlin.

Sodelujemo pri več raziskovalnih projektih kot vodje ali partnerji projekta. Vsebine projektov s cilji so dostopne tu.

V letu 2023 smo pričeli z novim bazičnim raziskovalnim projektom, ki ga financira Javna agencija za raziskovalno in inovacijsko dejavnost Slovenije Nove glive za biotično varstvo v trajnostni pridelavi jagod (J4-50140; 1. 10. 2023 do 30. 9. 2026), https://www.kis.si/Projekti_1/ARIS-J4-50140-jagode/ .

Osebje mikološkega laboratorija:

dr. Janja Zajc Žunič, znanstvena sodelavka, vodja mikološkega laboratorija

dr. Hans-Josef Schroers, znanstveni svetnik

mag. Urša Prislan, strokovno-raziskovalna sodelavka

mag. Klara Šavli, mlada raziskovalka

Aleksandra Podboj Ronta, strokovna sodelavka

Maruša Trobec, univ. dipl. mikrobiol., strokovno-raziskovalna sodelavka

 

Povezave:

Biotično varstvo - Glive: https://www.ivr.si/obvladovanje-skodljivih-organizmov/koristni-organizmi/glive/

Ali poznate fitoftore - uničujoče plesni? https://www.gov.si/novice/2020-04-20-ali-poznate-fitoftore-unicujoce-plesni/

Odpornost pšenične listne pegavosti proti fungicidom in učinkovite strategije njenega nadzora:

https://www.ivr.si/app/uploads/2024/05/IVR_Psenicna-listna-pegavost-odpornost-in-nadzor_2024.pdf

Pogoste bolezni in škodljivci rastlin (2021):

https://www.ivr.si/app/uploads/2022/09/KIS_Bolezni_in_Skodljivci_Rastlin_2021-10-18-FIN.pdf

PRVA NAJDBA GLIVE Verticillium dahliae, POVEZANE Z OVENELOSTJO POGANJKOV OLJK V SLOVENSKI ISTRI:

https://www.ivr.si/app/uploads/2023/01/Prva-najdba-glive-Verticillium-dahliae-povezane-z-ovenelostjo-poganjkov-oljk-v-slovenski-Istri.pdf