dr. Nik Susič

2019–danes: Raziskovalec, Kmetijski inštitut Slovenije, Oddelek za varstvo rastlin, Ljubljana, Slovenija.

2019, 2023 (2 meseca): Bioinformacijsko usposabljanje, Institut National de la Recherche Agronomique, Institut Sophia Agrobiotech, INRA-UNS-CNRS, Sophia-Antipolis, Francija.

2019 (1 mesec): Bioinformacijsko usposabljanje, Institute of Evolutionary Biology, University of Edinburgh, Edinburg, Škotska, Združeno Kraljestvo.

2015–2019: Mladi raziskovalec, Kmetijski inštitut Slovenije, Oddelek za varstvo rastlin, Ljubljana, Slovenija.

2015 (4 mesece): Tehnični svetovalec in družbenik, Algamteknol d.o.o., Šempeter pri Gorici, Slovenija.

2014–2015: Strokovna praksa, Universität für Bodenkultur (BOKU), Plant Biotechnology Unit, Dunaj, Avstrija.

2010–2013: Strokovno in magistrsko delo, Biotehniška fakulteta (Univerza v Ljubljani), Katedra za genetiko, biotehnologijo, statistiko in žlahtnjenje rastlin, Ljubljana, Slovenija.

• NEM-EMERGE HORIZON-RIA-GA 101083727: An integrated set of novel approaches to counter the emergence and proliferation of invasive and virulent soil-borne nematodes (2024-2027).
• ARIS L7-50153 RESENSE-VITIS: Zgodnje zaznavanje in upravljanje z boleznimi vinske trte / Early detection and management of important grapevine diseases (2023-2026).
• EXCALIBUR H2020-RIA-GA 817946: Exploiting the multifunctional potential of belowground biodiversity in horticultural farming (2019-2024).
• ARRS L4-1840: Nove prakse za blaženje abiotskega in biotskega stresa koruze v luči klimatskih sprememb / New management practices for mitigating abiotic and biotic stresses in maize under changing climate conditions (2019-2022).
• NemDetect GP/EFSA/ALPHA/2018/02: Zgodnje zaznavanje okužb krompirja s karantenskimi ogorčicami s pomočjo daljinskega zaznavanja / Image analysis for early detection of quarantine plant pests – Root-knot nematodes and Cyst nematodes (2019-2022).
• ARRS Bilateralni projekt med Slovenijo in Francijo – PROTEUS: Bioinformatske analize genomov nevarnih tropskih vrst ogorčic koreninskih šišk za razkritje razvoja vrst in virulence ter določitev diagnostičnih markerjev / Bioinformatics analysis of genomes for emerging tropical root-knot nematodes to unveil species histories, virulence and diagnostic markers (2020-2021).
• ARRS Programska skupina P4-0072: Agrobiodiverziteta (2015-2021).
• ARRS Programska skupina P4-0431: Kmetijstvo naslednje generacije (2022-).
• Euphresco 2016-A-199 MeloTrop: Vpliv podnebnih sprememb na razširjenost ogorčic iz skupine tropskih ogorčic koreninskih šišk / Global warming and distribution of root-knot nematode species of the tropical group (2017-2020).
• Core Organic Cofund BIOVINE: Izkoriščanje biodiverzitete v vinogradih z namenom zmanjšanja vpliva škodljivcev, zmanjšanja uporabe pesticidov ter povečanja ekosistemskih uslug / Exploit biodiversity in viticultural systems to reduce pest damage and pesticide use, and increase ecosystems services provision (2018-2021).

Nik Susič se je po opravljeni splošni Gimnaziji v Novi Gorici leta 2007, vpisal na študij Biotehnologije na Biotehniški fakulteti, Univerze v Ljubljani. Dodiplomsko izobraževanje je dokončal leta 2014 z zagovorom Magistrske naloge. Delo na področju rastlinske biotehnologije je nadaljeval na Univerzi BOKU na Dunaju (Avstrija) v razvoju novih sistemov tarčne mutageneze pri rastlinah. Oktobra 2015 je začel z doktorskim študijem Bioznanosti, smer Bioinformatika, ter se zaposlil kot mladi raziskovalec na Kmetijskem inštitutu Slovenije (KIS). Doktorsko delo je zajemalo raziskave s področja nematologije in uporabo metod molekularne identifikacije, bioinformatike, genomike, daljinskega zaznavanja ter biotičnega varstva pred napadi ogorčic koreninskih šišk (RKN). Rezultat je bil do takrat najpopolnejši javno dostopen referenčni genom ogorčic iz rodu Meloidogyne. Tekoče raziskovalno delo še naprej obsega študije biotičnega in abiotičnega stresa pri rastlinah, genomike in biotičnega varstva pred RKN, ter uporabe daljinskega zaznavanja v nematologiji.

Rastlinsko-parazitske ogorčice (Meloidogyne spp.);  biokemijska in molekularna diagnostika rastlinsko-parazitskih ogorčic; biotično zatiranje škodljivcev; interakcije rastline-mikrobi-škodljivci; aplikacije daljinskega zaznavanja v nematologiji; genomika nematod.

2020 Nagradna štipendija Mednarodne federacije nematoloških združenj (IFNS) za udeležbo na 7. Mednarodni nematološki konferenci (ICN), Antibes Juan-les-Pins, Francija (konferenca prestavljena v leto 2022).

2018 Priznanje znanstvenega sveta KIS za znanstveno-raziskovalni dosežek v letu 2018 za pomembno znanstveno objavo z naslovom: Susič in sod. 2018. Discrimination between abiotic and biotic drought stress in tomatoes using hyperspectral imaging. Sensors and Actuators B: Chemical.

2014 Prešernova nagrada Univerze v Ljubljani za Magistrsko delo z naslovom: Vzpostavitev in optimizacija protokola za transformacijo oranžnega krinkarja (Mimulus aurantiacus Curtis) z bakterijo Agrobacterium tumefaciens.

ESN – European Society of Nematologists

• ŽIBRAT Uroš, GERIČ STARE Barbara, KNAPIČ Matej, SUSIČ Nik, LAPAJNE Janez, ŠIRCA Saša. Detection of root-knot nematode Meloidogyne luci infestation of potato tubers using hyperspectral remote sensing and real-time PCR molecular methods. Remote sensing. 2021, 13(10): 1-21. https://www.mdpi.com/2072-4292/13/10/1996.
• SUSIČ Nik, JANEŽIČ Sandra, RUPNIK Maja, GERIČ STARE Barbara. Whole genome sequencing and comparative genomics of two nematicidal Bacillus strains reveals a wide range of possible virulence factors. G3. 2020, 10(3): 881-890. DOI: 10.1534/g3.119.400716.
• SUSIČ Nik, KOUTSOVOULOS Georgios D., RICCIO Cristian, DANCHIN Étienne G. J., BLAXTER Mark L., LUNT David H., STRAJNAR Polona, ŠIRCA Saša, UREK Gregor, GERIČ STARE Barbara. Genome sequence of the root-knot nematode Meloidogyne luci. Journal of nematology. 2020, 52, e2020-25: 1-5. DOI: 10.21307/jofnem-2020-025.
• SUSIČ Nik, ŽIBRAT Uroš, SINKOVIČ Lovro, VONČINA Andrej, RAZINGER Jaka, KNAPIČ Matej, SEDLAR Aleš, ŠIRCA Saša, GERIČ STARE Barbara. From genome to field-observation of the multimodal nematicidal and plant growth-promoting effects of Bacillus firmus I-1582 on tomatoes using hyperspectral remote sensing. Plants. 2020, 9(5): 1-27. DOI: 10.3390/plants9050592.
• SUSIČ Nik, ŽIBRAT Uroš, ŠIRCA Saša, STRAJNAR Polona, RAZINGER Jaka, KNAPIČ Matej, VONČINA Andrej, UREK Gregor, GERIČ STARE Barbara. Discrimination between abiotic and biotic drought stress in tomatoes using hyperspectral imaging. Sensors and actuators B Chemical. 2018, 273: 842-852. DOI: 10.1016/j.snb.2018.06.121.
• SUSIČ Nik, BOHANEC Borut, MUROVEC Jana. Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of bush monkey-flower (Mimulus aurantiacus Curtis) with a new reporter gene ZsGreen. PCTOC. 2014, 116: 243-251. DOI: 10.1007/s11240-013-0402-3.