Financer

V okviru iniciative PRIMA je nacionalni financer Javna agencija za raziskovalno dejavnost RS, šifra projekta N4-0147

Prepoznavanje raznolikosti predstavlja dragoceno orodje za prilagajanje kmetijskih rastlin okoljskim spremembam, ki predstavljajo velik izziv za kmetijstvo v prihodnosti. Križnice, ki v veliki meri prispevajo k proizvodnji hrane po vsem svetu, izvirajo iz Sredozemlja. Divje oblike in lokalne/krajevne populacije rastejo in so prilagojene kontrastnemu okolju. Cilj BrasExplor je izkoristiti ta veliki gradient podnebnih in talnih razmer ter zbrati in raziskati to široko genetsko raznolikost divjih in gojenih oblik, ter identificirati ključne gene za posamezne lastnosti. Pogovori s kmeti in lokalnim prebivalstvom bodo omogočili natančno analizo kmetijskih praks in uporabe proizvodov. Zbiranje se bo izvajalo vzdolž podnebnega gradienta z natančnim opisom kontrastnih okoljskih razmer, lokacij in mikrobiomske sestave tal. Iz 100 populacij kapusnic (Brassica oleracea) in 100 repe/oljne repice (B. rapa) bomo s pomočjo sekvenc (Next Generation Sequencing) analizirali genom posamezne populacije, iskali povezave med nukleotidnim polimorfizmom in spremenljivkami okolja in sestave tal z nalogo identificirati genetske dejavnike prilagajanja na suboptimalne pogoje. Ti podatki bodo potrjeni v nadzorovanih pogojih za posamezne fenotipske lastnosti (kalitev semena, koreninska arhitektura, fenologija cvetenja, samoinkompatibilnost, temperaturni in vodni pogoji) ter združeni s transkriptomskimi analizami. Genetski podatki bodo uporabljeni tudi za pridobitev informacije o njihovi populacijski genetski strukturi in za razumevanje povezav med divjimi in gojenimi oblikami vsake vrste (zgodovina udomačevanja, kmetijske prakse in okoljske omejitve). Rezultati bodo omogočili razvoj jedrnih zbirk, bodo v pomoč in-situ/na kmetiji in ex-situ ohranjanju genskih virov, programom žlahtnjenja in bodo lahko uporabljeni za promocijo lokalnih/krajevnih populacij.